Su deseo es estar con la selección peruana, pero una lesión en la rodilla derecha le impediría estar en los amistosos ante España y México. Juan Manuel Vargas confirmó lesión a la rodilla derecha y dijo que desea recuperarse totalmente para los partidos eliminatorios con Colombia y Uruguay.
"Tengo una inflamación en la rodilla y estoy manejando el tema con el doctor de Catania. Yo 
quiero estar con la selección peruana, pero a mí me interesa jugar los partidos eliminatorios y no arriesgar antes", dijo el lateral del Calcio Catania quien sigue en duda para el cotejo ante la Juventus del fin de semana. Asimismo, el ‘Loco’ manifestó que en estos momentos su mente esta solo en salvar la categoría de su club. "Estos últimos partidos son importantes porque nos jugamos la permanencia. Dios quiera que las cosas nos salgan bien", sostuvo al programa Central Deportiva. Terra Perú
Esta mal, porque no se cuidan al momento de jugar, porque en partidos claves nunca estan o estan lesionados, siempre es lo mismo, no participan en partidos importantes amistosos en este caso estos 2 partidos y si se recuperan alguien asegura que ganaran los partidos con colombia y uruguay?, mira que podria ser que caigan en los amistosos y puede ser en las eliminatorias, que desastre son, mira que seria el colmo que no sacaran buenos resultados en estos 4 partidos que tendra la seleccion peruana, si quieren a su pais arriesguense , sobre Juan Vargas el catania es un equipo chico y el se estado matando por salvar un equipo ascendido , te lesionas para partidos importantes, deberias desprenderte del catania y tratar de darle prioridad a la seleccion peruana. Deberia apresurar buscar un equipo donde no se este matando tanto, es un buen jugador con talento y deberia estar en un equipo de mejor nivel.